FAIRTraits: an enriched, FAIR-compliant database of plant traits from Mediterranean populations of 240 species

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Descripción

FAIRTraits compiles and standardizes plant trait data collected over the 1997-2023 period on six sites by the same research group, ensuring that a consistent methology was followed. These data were obtained on individuals from 1,955 populations of 240 species belonging to 155 genera and 48 families (172 herbaceous and 39 woody species).FAIRTraits contains 189,452 records for 183 quantitative traits from the different plant organs (leaves, stems, roots, and reproductive parts), which have been grouped into 10 categories: allocation ratio, architecture, chemistry, dynamics, mechanics, microbial associations, morphology, phenology, physiology and plant size. Trait values are given at the level of individual measurements.The complete FAIRTraits database in composed of six other files. One is available at GBIF as a separate Darwin Core "Checklist" archive: (1) FAIRTraits_Taxon, which gives further details on taxa;The other five are available in the InDoRES repository, as .csv files. These are: (2) FAIRTraits_MeteoSitesMonth.csv, which gives data on monthly averages of meteorological variables from the meteorological stations closest to the six sites;(3) FAIRTraits_MeteoSitesYear.csv, which gives data on yearly averages of meteorological variables from the meteorological stations closest to the six sites;(4) FAIRTraits_EnvironmentalPlots.csv, which gives information on georeferencing, treatments, type of soils and soil properties of plots in which environmental data were collected;(5) FAIRTraits_DescriptionEnvVariables.csv, which gives a description of variables, methods and items found in files FAIRTraits_MeteoSitesMonth.csv, FAIRTraits_MeteoSitesYear.csv and FAIRTraits_EnvironmentalPlots.csv(6) FAIRTraits_PublishedPapers.csv, which gives a list of scientific articles in which subsets of the database have been used.A data paper submitted to the "Ecology" journal describes the database in detail.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 189.452 registros.

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Garnier, E., Delalandre, L., Segrestin, J., Barkaoui, K., Kazakou, E., Navas, M.-L., Vile, D., Violle, C., Bellmann, A., Bernard-Verdier, M., Birouste, M., Blanchard, A., Bumb, I., Cruz, P., Debain, S., Fayolle, A., Fortunel, C., Grigulis, K., Laurent, G., Lavorel, S., Lloret, F., Pérez-Ramos, I. M., Prieto, I., Richarte, J. & Roumet, C.. FAIRTraits: an environmentally, methodologically and semantically enriched database of plant traits from Mediterranean populations of 240 species. Data paper submitted to Ecology.

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es GBIF France. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento-NoComercial (CC-BY-NC 4.0).

Registro GBIF

Este recurso no ha sido registrado en GBIF

Palabras clave

Biodiversity standards; ecosystem properties; environmental conditions; Mediterranean Biogeographic Region; leaf stem and root traits; plant functional traits; gas exchange; litter mass loss; phenology; reproductive traits; terminological resources; trait-based ecology; Observation

Contactos

Eric Garnier

Originador ●
Punto De Contacto

Research Director

CNRS

34293 Montpellier

eric.garnier@cefe.cnrs.fr

(+) 33 4 67 61 32 42

https://www.cefe.cnrs.fr/fr/recherche/ef/ecopar/833-c/146-eric-garnier

Cyrille Violle

Punto De Contacto

Research Director

CNRS

34293 Montpellier

cyrille.violle@cefe.cnrs.fr

(+) 33 4 67 61 33 42

https://www.cefe.cnrs.fr/fr/recherche/ef/ecopar/833-c/203-cyrille-violle

Karim Barkaoui

Punto De Contacto

Staff Researcher

CIRAD

34398 Montpellier

karim.barkaoui@cirad.fr

(+) 33 4 67 61 56 68

https://amap.cirad.fr/en/annuaire.php?lettre=B

GBIF France

Distribuidor

GBIF France

75005 Paris

Cobertura geográfica

Trait data in FAIRTraits have been collected at the north-western edge of the Mediterranean Biogeographic Region, in five sites located in southern France and one site located in north-eastern Spain.

Coordenadas límite	Latitud Mínima Longitud Mínima [41,304, 1,891], Latitud Máxima Longitud Máxima [43,933, 6,587]

Cobertura taxonómica

Data were obtained on individuals from 240 species belonging to 155 genera and 48 families of higher plants. There were 238 Angiosperm and 2 Gymnosperm species. Further details are available in the FAIRTraits_Taxon GBIF archive.

Familia	Ericaceae, Poaceae, Geraniaceae, Buxaceae, Polygalaceae, Brassicaceae, Rubiaceae, Lamiaceae, Gentianaceae, Smilacaceae, Cistaceae, Araliaceae, Fabaceae, Crassulaceae, Violaceae, Campanulaceae, Fagaceae, Thymelaeaceae, Boraginaceae, Caprifoliaceae, Plantaginaceae, Resedaceae, Rhamnaceae, Viburnaceae, Sapindaceae, Rosaceae, Ranunculaceae, Saxifragaceae, Aristolochiaceae, Rutaceae, Cyperaceae, Vitaceae, Arecaceae, Apiaceae, Convolvulaceae, Oleaceae, Primulaceae, Asparagaceae, Cupressaceae, Linaceae, Caryophyllaceae, Pinaceae, Asteraceae, Orobanchaceae, Euphorbiaceae, Polygonaceae, Anacardiaceae, Thesiaceae

Familia

Ericaceae, Poaceae, Geraniaceae, Buxaceae, Polygalaceae, Brassicaceae, Rubiaceae, Lamiaceae, Gentianaceae, Smilacaceae, Cistaceae, Araliaceae, Fabaceae, Crassulaceae, Violaceae, Campanulaceae, Fagaceae, Thymelaeaceae, Boraginaceae, Caprifoliaceae, Plantaginaceae, Resedaceae, Rhamnaceae, Viburnaceae, Sapindaceae, Rosaceae, Ranunculaceae, Saxifragaceae, Aristolochiaceae, Rutaceae, Cyperaceae, Vitaceae, Arecaceae, Apiaceae, Convolvulaceae, Oleaceae, Primulaceae, Asparagaceae, Cupressaceae, Linaceae, Caryophyllaceae, Pinaceae, Asteraceae, Orobanchaceae, Euphorbiaceae, Polygonaceae, Anacardiaceae, Thesiaceae

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final	1997-10-21 / 2023-03-05

Datos del proyecto

FAIRTraits assembles plant trait data collected by the ECOPAR research group at the Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (Montpellier), during the course of 12 research projects over the 1997-2023 period. Details of the individual projects are given in the "Related Projects" section below, and are further described in the data paper associated with FAIRTraits.

Título	FAIRTraits
Fuentes de Financiación	See below in the "Related Projects" section.
Subvención al Proyecto	OpenMetaPaper French Ministry of Higher Education and Research AAPFNSO2019OpenMetaPaper-14026
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