Fish sample collection

Occurrence
Dernière version Publié par GBIF France le mars 3, 2023 GBIF France
Date de publication:
3 mars 2023
Publié par:
GBIF France
Licence:
CC-BY 4.0

Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :

Données sous forme de fichier DwC-A (zip) télécharger 323 752 enregistrements dans Français (20 MB) - Fréquence de mise à jour: annuel
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Description

For many years now, within the framework of ORE DiaPFC, SOERE OLA or the OFB-INRAE-Institut Agro-UPPA Cluster, various INRAE units (U3E, UMR ECOBIOP and UMR CARRTEL) and OFB (DRAS ) take samples from many aquatic specimens. These samples, usually scales or fins, are then used by the scientific community to carry out various analyzes and research. Labeled Biological Resource Center (CRB) by the GIS IBISA, Colisa is part of the BRC4Env environment pillar of the RARE infrastructure. Our catalog references these different hard tissue samples and offers a module allowing you to perform queries on our database and select the types of data likely to interest you. You can then export this data.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 323 752 enregistrements.

6 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
323752
MeasurementOrFacts 
1295008
MaterialSample 
323752
Permit 
323752
Preparation 
323752
Preservation 
323752
ResourceRelationship 
323752

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Marchand F, Azam D, Lange F, Josset Q, Jeannot N, Goulon C, Guéraud F (2023): Fish sample collection. v1.4. GBIF France. Dataset/Occurrence. https://ipt-uat.gbif.fr/resource?r=colisa&v=1.4

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est GBIF France. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 305f13cb-b5a6-4f4d-a338-f3af7a13fcc5.  GBIF France publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF France.

Mots-clé

Occurrence;ichthyological sample;Genetic Resource

Contacts

Frédéric Marchand
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
  • Personne De Contact
  • Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
  • 65 rue de St Brieuc, CS 84215
Rennes
  • +33 223485786
Didier Azam
  • Créateur
  • Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
  • 65 rue de St Brieuc, CS 84215
Rennes
  • +33 223485786
Frédéric Lange
  • Créateur
  • Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, Agrocampus-Ouest, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
  • Aquapôle - Ibarron
St-Pée-sur-Nivelle
FR
  • +33559515975
Quentin Josset
  • Créateur
  • Researcher
OFB, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
  • 92 Chaussée de Picardie
76260 Eu
FR
  • +33276375078
Nicolas Jeannot
  • Créateur
  • Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
  • Moulin des Princes
56620 Pont-Scorff
FR
  • +33297325429
Chloé Goulon
  • Créateur
  • Researcher
INRAE USMB
  • 75 bis avenue de Corzent
74203 THONON LES BAINS
FR
  • +33450267800
François Guéraud
  • Créateur
  • Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, Agrocampus-Ouest, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
  • Aquapôle - Ibarron
St-Pée-sur-Nivelle
Agnès Starck
  • Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
  • 65 rue de St Brieuc, CS 84215
35042 Rennes
  • +33 223485786
Nadine Renault
  • Programmeur
  • Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
  • 65 rue de St Brieuc, CS 84215
35042 Rennes
FR

Couverture géographique

The samples come mainly from France (metropolitan and Kerguelen Islands)

Enveloppe géographique Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180]

Couverture taxonomique

Model species, preferentially used by the scientific community to study biological mechanisms whose results can be extended to other less accessible or less documented species based on the conservation of functions and genes during evolution.

Species Salmo salar (Atlantic Salmon), Salmo trutta (Sea trout), Onchorynchus mykiss (Rainbow Trout), Cyprinus carpio (Common carp, European carp, King carp, Mirror carp), Sparus auratus (Gilthead seabream)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1958-12-18 / 2023-02-18

Méthodes d'échantillonnage

The samples come from scientific monitoring and from amateur and professional fishing.

Etendue de l'étude French metropole and Kerguelen island
Contrôle qualité The Colisa Biological Resource Centre is ISO 90001 certified

Description des étapes de la méthode:

  1. - Samples of scales or other tissues are taken from fish during fish surveys. The fish are returned to the water. Otoliths are collected from fish found dead or caught by amateur fishermen. - Age is verified from scale reading according to standard methods described by Baglinière and Le Louarn (1987) and Richard and Baglinière (1990).

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 305f13cb-b5a6-4f4d-a338-f3af7a13fcc5
https://ipt-uat.gbif.fr/resource?r=colisa